大棚作物要高產，一個重要條件是要創造一個良好的環境條件，才能獲得優質高產，棚室栽培是在相對固定和連續多年的重茬種植，造成了棚室土壤及棚室內墻體、立柱等材料上的病原菌及蟲卵的大量積累、繁殖，尤其是一些土傳病害如根結線蟲病、枯黃萎病、根腐病、疫病等的連年發生，如不加以防治，會對生產造成很大的影響。所以，必須提倡在休閑期抓緊有利時期對大棚進行消毒，切實抓住以下幾個方面的消毒工作。

（1）棚室消毒

大棚內溫暖、濕度較大，適合于多種病原生物的繁殖和害蟲越冬，經過2年以上的生產后，病蟲害的種類增多，而且逐年加重，植物殘枝落葉必須徹底清除后，對棚室進行消毒。一是采用硫磺熏蒸法。密閉大棚數日后，選晴天進行，每立方米空間用硫磺4克，鋸末8克，于晚上7時，每隔2米距離堆放鋸末，攤平后撒一層硫磺粉，倒入少量酒精，逐個點燃，24小時后放風排煙。這種方法消毒效果好，取材容易，成本很低。也可用百菌清等煙熏劑消毒，每隔7～10天煙熏1次，連續3次以上，效果顯著。方法是清理田園后嚴格密閉即可煙熏。可用45%百菌清煙熏劑或30%速克靈煙熏劑或百菌清和速克靈混合煙熏劑，對灰霉病為主的病害防效顯著。煙熏劑的劑量為每立方米空間0.2～0.3克。每畝用量：30%速克靈熏煙劑300～500克，45%百菌清煙熏劑200～250克，均勻放置后，分別點燃，隨即密閉煙熏2～3小時。

（2）大棚骨架及輔助設施消毒

對大棚骨架、營養缽等育苗器具、生產工具等可用1%～2%福爾馬林水溶液均勻噴灑或洗刷后密封消毒，或用敵克松（濃度為30m克/L）液消毒。

（3）土壤消毒

對土壤進行消毒是控制土傳病蟲害的重要措施之一，已逐漸成為廣大菜農所接受。而消費者對無公害農產品、綠色食品甚至有機食品的追求，也對藥劑防治提出了更高的要求。因此，在開展大棚土壤消毒時，必須更多地依靠農業防治、物理防治、生態防治等綜合防治措施。土壤消毒的方法有多種，目前主要采用的有以下幾種：

高溫悶棚：一般在7月上旬至8月下旬進行。用大棚膜和地膜進雙層覆蓋，嚴格保持大棚的密閉性，在這樣的條件下處理，地表下10公分處最高地溫可達70℃，20公分深處地地溫可達45℃以上，這樣高的地溫殺菌率可達80%以上。大多數病菌不耐高溫，經過10多天的熱處理即可被殺死。如一些立枯病病菌，黃瓜的菌核病病菌、黃瓜疫病病菌、茄子黃萎病病菌等都不太耐高溫；但是也有的病菌特別耐高溫，如根腐病病菌、根腫病病菌和枯萎病病菌等一些深根性土傳病菌，由于其分布的土層深，必須處理30～50天才能達到較好的效果。因此，進行土壤消毒時，應根據棚內所種作物及其相應病菌的抗熱能力來確定消毒時間。高溫悶棚對不超過15公分深的土壤效果最好，對超過20公分深的土壤消毒效果較差，因此，土壤消毒后最好不要再翻耕，即使耕翻也應局限于10公分的深度。否則，會將下面土壤的病菌重新翻上來，發生再污染。高溫悶棚能大幅度降低田間的病菌密度，大大減少作物發病的機會。對有根結線蟲的大棚，悶棚后在用底肥時，每畝可用阿維菌素有機肥或克線蛆菌有機肥400千克，可以基本上消除根結線蟲的為害。

使用土壤消毒劑：

一是溴甲烷,使用前清除殘存秸稈及根系，深翻土壤至少30公分，施好底肥，打碎大土塊，保證土壤20公分深處溫度至少在8℃以上，溫度越高，熏蒸作用越強。處理時搭小拱棚，棚膜要蓋嚴。一般每畝用藥40千克，每13平方米放1罐藥，藥罐下墊一小塊塑料布，施藥時將藥罐卡于開罐器上，隔著覆蓋的棚膜，溴甲烷呈液態瀉出于下墊的塑料布上，幾分鐘后氣化。使用溴甲烷一定要謹慎，通風期間嚴禁農事操作，熏蒸期要達到15天左右，揭開薄膜通風30天以上才可種植。由于溴甲烷對病菌、雜草、線蟲、昆蟲和螨類等均有效，并且使用溴甲烷對黃瓜、番茄有明顯的增產效果，目前使用較為廣泛。

二是棉隆。棉隆是一種低毒的土壤消毒劑，相對于氰氨化鈣和溴甲烷來說更安全。棉隆在潮濕的土壤中會產生異硫氰酸甲酯氣體，迅速擴散至土壤顆粒間，有效殺滅土壤中各種線蟲、病菌、地下害蟲及雜草種子，從而達到清潔土壤、疏松活化土壤的效果。使用方法：土壤施好底肥后深翻（約30公分）整平，澆水保濕3～4天，待土壤濕度在40%～60%時,用旋耕機旋耕。然后將棉隆均勻地撒在地表，每畝用藥20～30千克，施藥后立即用塑料布覆蓋。棉隆分解產生的氣體比空氣輕，要確保塑料布沒有破損，不能用地膜等太薄的塑料布，且四邊用土壓實，密封好。密封期保證在12天以上，結束后揭去塑料布，通風1星期后取土做發芽試驗，確保安全后才可進行育苗。

三是石灰氮。悶棚結束后將棚膜、地膜揭掉，耕翻、晾曬，即可種植。石灰氮在土壤中分解產生單氰胺和雙氰胺，這兩種物質對線蟲及其他土傳病害有很強的殺滅作用。同時石灰氮中的氧化鈣遇水放熱，促使麥草腐爛，有很好的肥效。夏季高溫，棚膜保溫，地熱升溫，白天地表溫度可高達65～70℃，10公分地溫高達50℃以上，這樣可以有效殺滅土壤中各種病蟲害和雜草。在對棚室進行完消毒處理以后，棚室內的有害病原得到了有效的控制，這時要防止病原菌的再度傳入，同時要及時增施生物菌肥，以增加土壤內的有益菌群，在使用了生物菌肥的棚室內，一定要注意定植時不要再使用藥劑，以免使用的藥劑會殺死有益菌，造成不必要的浪費。

四是其他藥劑。以土壤傳播侵染的病害有黃萎病、青枯病、枯萎病。防治這些病害，可在定植前半個月，沿畦溝澆福爾馬林100～200倍液，然后用聚乙烯薄膜覆蓋并密封5天。一星期后，在藥劑全部揮發后方可定植。也可用50%的多菌靈、50%托布津、75%敵克松1000倍液、雙效靈、抗枯靈300倍液澆灑土壤。防治線蟲、昆蟲、部分草籽、輪枝菌及其他真菌，可用噴射器向土壤中噴射氯化苦，每隔20～30公分、8～15公分深土壤注入2～4毫升，或每立方米土壤（或營養土）施入150毫升，用塑料薄膜等覆蓋密封3天，處理后經較長時間風干后方可使用。對疫病、霜霉病比較嚴重的棚室，可以用0.5千克的硫酸銅兌水100～150千克澆灑土壤消毒。